
FLOT1 and EEF1D: Two genes that may link poor sleep to Alzheimer’s disease
多年来,我们已知睡眠不佳与阿尔茨海默病相伴相生。问题在于,它们是彼此的“乘客”还是“司机”?一项发表于 Frontiers in Aging Neuroscience 的新研究为这一谜题增添了分子层面的解释,鉴定出两个基因,,FLOT1 和 EEF1D,,它们可能位于睡眠缺失与神经退行性变的交汇点,并由一种名为 ac4C 的鲜为人知的 RNA 修饰所连接。 这项由西安交通大学第一附属医院的赵贝宇及其同事主导的分析,结合了批量 RNA 测序、单细胞 RNA 测序、机器学习算法以及孟德尔随机化(一种利用遗传变异探究因果关系的统计技术)。研究团队利用了来自 GEO 数据库的多个公共数据集,并在阿尔茨海默病(AD)患者及睡眠剥夺(SD)个体的外周血样本中验证了其发现。 研究发现 研究人员首先筛选了在阿尔茨海默病中差异表达且与 N4-乙酰胞苷(ac4C)相关的基因。ac4C 是 RNA 分子上的一种化学标签,影响 RNA 的稳定性及其翻译成蛋白质的效率。通过这一筛选,两个基因在 AD 与睡眠剥夺之间持续重叠:FLOT1(flotillin-1)和 EEF1D(真核翻译延伸因子 1 delta)。 FLOT1 编码一种位于脂筏(细胞膜上的特化微结构域)中的蛋白质,参与膜运输和神经元间的信号传递。EEF1D 是蛋白质合成机制的一部分,在翻译过程中帮助延伸多肽链。两者都参与基本的细胞过程,并且似乎都受到 ac4C 修饰的调控,而这种调控在阿尔茨海默病和慢性睡眠紊乱中可能出现异常。 为了加强这一关联,研究团队使用了孟德尔随机化(MR),该方法利用受孕时基因的随机分配来模拟自然实验。MR 分析支持了因果关系:影响 FLOT1 和 EEF1D 表达的遗传变异与阿尔茨海默病风险相关,表明这些基因的失调不仅与 AD 相关,还可能促使其发生。 通路富集分析显示,这些共享基因参与溶酶体通路、趋化因子信号传导以及白细胞跨内皮迁移,这些过程均涉及细胞如何清除废物、与免疫系统沟通以及允许免疫细胞进入大脑。当研究人员使用单细胞 RNA 测序分析免疫细胞类型时,他们鉴定出髓源性抑制细胞(MDSCs)是与共享信号相关的关键免疫细胞群体。特别是在阿尔茨海默病的大脑中,小胶质细胞、CD4+ T 细胞、CD8+ T 细胞和自然杀伤(NK)细胞是最显著涉及的细胞类型。 最后,研究团队通过测量 AD 患者和睡眠剥夺个体外周血中 […]










