DNA模仿阿基米德螺旋作为纳米级分子泵

伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校的研究团队通过高分辨率分子动力学模拟证明,在碳纳米管内旋转的DNA双螺旋可以逆浓度梯度输送水和离子,这是阿基米德螺旋(人类最古老的泵送机制之一)的分子级版本。

这项以预印本形式发表在bioRxiv上的研究表明,螺旋泵(2000多年前为灌溉提水而发明)的原理可以转化到重力和惯性可忽略不计的尺度。

工作原理

DNA双链在纳米尺度上充当阿基米德螺旋的螺旋叶片。当在碳纳米管内旋转时,DNA的自然螺旋形状会舀起水和离子,将其输送到管中。不同货物的机制不同:水的输送主要由旋转双链的立体形状驱动,物理扫掠运动拖曳水分子;离子的输送(特别是阳离子)更快,由带负电的DNA骨架与带正电的离子之间的静电相互作用驱动。

关键在于,扭矩驱动的双链可以逆浓度梯度(从低浓度到高浓度)移动离子,这是泵的定义特征,也是使阿基米德螺旋原理在分子尺度上具有意义的特性。

旋转诱导的离子通量取决于特定的阳离子类型,这提出了纳米尺度离子分离的可能性。

目前仅为模拟

这项由UIUC物理系的Xavier Mleziva、Christopher Maffeo和Aleksei Aksimentiev开展的研究完全是计算性的。正如Julia Vaz在《科学》杂志新闻文章中所指出的,”在碳纳米管内安装并固定DNA双螺旋”的工程挑战在现实世界中仍未解决。目前尚未有实验实现得到证实。

重要性

这是首次证明宏观泵原理可以利用天然生物螺旋在分子尺度上运行。宏观泵依赖重力和惯性,这些力在纳米尺度上实际上为零,因此这种转化绝非易事。

如果实验实现能够达成,潜在应用包括在微小尺度上移动分子的芯片实验室技术、生物物质的分离和浓缩以及分子尺度流体处理。

该研究由美国国家科学基金会(ID-2411133)资助。

免责声明:基于未经同行评审的bioRxiv预印本。该研究完全是计算性的(分子动力学模拟),没有实验实现。

婷 翻译

来源:

1. Mleziva X, Maffeo C, Aksimentiev A. “DNA: A Nanoscale Archimedes’ Screw.” bioRxiv. 2026. DOI: 10.64898/2026.06.25.734429

2. 转载自《科学》AAAS。https://www.science.org/content/article/dna-could-act-famed-gravity-defying-pump

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