
章鱼因其分布式神经系统,伪装能力和工具使用而长期令生物学家着迷。现在,研究人员发现了一种分子特性,可能有助于解释它们生物学特殊性的另一个维度:浅水章鱼的核糖体RNA带有一个独特的断裂,使其蛋白质构建机器的精确度约为近亲的两倍。
这一发现以预印本形式发布在bioRxiv上,并将在Current Biology上发表,揭示了28S核糖体RNA中螺旋88(H88)的转录后切割,这种结构性断裂存在于约15种浅水章鱼中,但在所有测试的深海章鱼,鱿鱼,墨鱼和其他软体动物中均不存在。该断裂大约在1亿年前出现,与浅水章鱼和深海章鱼谱系的分化时间相吻合。
断裂的工作原理
核糖体是细胞的蛋白质工厂,通过将转移RNA分子与每个密码子匹配,将信使RNA翻译成多肽链。这个过程快速但容易出错:野生型大肠杆菌的核糖体大约每1,000到10,000个密码子就会出错一次。
章鱼的H88断裂改变了核糖体的E位点(tRNA在递送氨基酸后离开的位置),改变了核糖体检查密码子-反密码子配对的方式。研究人员表明,携带章鱼H88断裂的工程化大肠杆菌的翻译错误比野生型大肠杆菌减少约50%,保真度提高了两倍。与鱿鱼核糖体相比,该断裂将近同源(错配)密码子的tRNA结合亲和力降低了约四倍,使核糖体更加严格,且无需牺牲速度。
最后一点是关键。在大多数生物体中,准确性是以速度为代价的,这是翻译中众所周知的速度-准确性权衡。章鱼的H88断裂似乎将两者解耦。研究人员测量发现,章鱼核糖体的翻译速度比鱿鱼或蛞蝓核糖体慢约30%,但这种减慢与H88断裂无关。在仅携带章鱼断裂的大肠杆菌中,翻译速度保持不变,而准确性却翻倍。
与RNA编辑的协同作用
章鱼广泛利用RNA编辑,在转录后重写其遗传信息以产生蛋白质多样性。但编辑后的信息携带肌苷,一种可能混淆标准核糖体的修饰核苷酸,导致错误折叠的蛋白质聚集形成有毒团块。
研究人员发现,人类核糖体在含肌苷的密码子处停滞。鱿鱼核糖体则混杂地通过它们,产生高度聚集的错误折叠蛋白质,比非编辑信息引起的聚集多约十倍。相比之下,章鱼核糖体选择性地解码含肌苷的密码子(偏好I:C配对),且不产生更多的聚集。H88断裂对这种清洁处理至关重要。
分辨率为3.2埃的冷冻电镜显示,H88断裂改变了核糖体A位容纳通道,tRNA进入进行密码子读取的通道,中的碱基配对相互作用。这种结构变化使核糖体在不减速的情况下更具区分力,并使其能够处理RNA编辑产生的异常核苷酸,而不会积累错误折叠的蛋白质。
进化背景
H88断裂在浅水章鱼中完全保守,断裂位点的核苷酸序列TATG/CGTC存在于每个测试过的浅水物种中。它在同一时期分化的姐妹谱系,深海章鱼中的缺失表明,该断裂与章鱼的祖先普遍性无关,而是特定地与浅水物种中复杂行为的扩展相关:捕猎,伪装,工具使用和精细的社会信号传递。
研究人员指出,在耐受广泛RNA编辑的同时产生高保真蛋白质的能力,可能是使章鱼认知如此独特的大型分布式神经系统进化的先决条件。蛋白质合成错误在神经元中尤其有害,错误折叠的蛋白质可能在一生中积累。
注意事项
这项工作目前以预印本形式在bioRxiv上发布(DOI: 10.64898/2026.06.25.734654),尚未完成完整的同行评审。关键发现,H88断裂增强大肠杆菌中的翻译准确性,是在异源系统中得出的;相同的定量效应是否在章鱼神经元中成立仍有待直接确认。该论文已被Current Biology接受,表明已通过编辑审查,但可能尚未达到最终出版形式。
Sources
[1] Mitra, R., Han, R., Scott, T.J., et al. “Evolution of a core ribosomal innovation in octopus.” bioRxiv (2026). DOI: 10.64898/2026.06.25.734654
[2] Smith, J. “Daily briefing: Mutation lets octopuses make proteins with precision.” Nature (2026). https://www.nature.com/articles/d41586-026-02177-1
[3] Reardon, S. “Molecular quirk unique to octopuses makes them better at building proteins.” Science (2026). https://www.science.org/content/article/molecular-quirk-unique-octopuses-makes-them-better-building-proteins
婷 翻译

