Par Marie — 1ban.news | 23 juillet 2026
Un vaccin oral expérimental contre Shigella sonnei a prévenu 89 % des cas de shigellose dans un groupe d’adultes américains délibérément infectés, selon un essai de phase 2 publié le 30 juin dans The Lancet Infectious Diseases. Il s’agit du signal d’efficacité le plus fort jamais rapporté pour un vaccin vivant atténué contre Shigella, dans un domaine qui n’a produit aucun produit homologué en plus d’un siècle de tentatives.
Ce chiffre repose toutefois sur un essai qui ne s’est pas déroulé comme prévu. Des problèmes de sécurité survenus en cours d’étude ont contraint les investigateurs à réduire de moitié la dose vaccinale, à supprimer un bras de l’essai et à restreindre les critères d’inclusion. Le chiffre d’efficacité regroupe deux doses différentes — et tous les cas de shigellose survenus chez les participants vaccinés l’ont été à la dose abandonnée.
Ce que l’essai a montré
Le vaccin, WRSs2, est une souche vivante mais atténuée de S. sonnei portant des délétions des gènes senA, senB et virG(icsA), administrée par voie orale. Entre octobre 2022 et janvier 2024, 108 adultes en bonne santé âgés de 18 à 49 ans et présentant une faible immunité préexistante contre S. sonnei ont été recrutés à l’université Emory et au Cincinnati Children’s Hospital Medical Center. Soixante-treize ont ensuite subi l’épreuve infectieuse : 28 jours après leur dernière dose, ils ont été hospitalisés puis ont ingéré environ 1 500 S. sonnei vivantes, avant de recevoir de la ciprofloxacine cinq jours plus tard.
Parmi les 34 ayant reçu deux doses de vaccin, trois ont développé une shigellose, selon l’adjudication d’un comité d’évaluation en aveugle. Parmi les 26 receveurs du placebo, 21 en ont développé une — soit un taux d’attaque de 81 %. Cela donne une efficacité vaccinale de 89 %, avec un intervalle de confiance à 95 % de 71 à 96.
Les formes sévères ont été réduites davantage encore : un cas parmi les 34 vaccinés contre 18 parmi les 26 sous placebo, soit une efficacité de 96 % (IC 95 % 78–99). Cette analyse était post hoc et reposait sur une définition de cas programmatique plutôt qu’adjudiquée ; elle pèse donc moins que le résultat principal.
Pour situer ce résultat : un vaccin conjugué antérieur, S. sonnei-rEPA, avait atteint 74 % d’efficacité dans un essai de terrain chez de jeunes adultes, mais n’offrait aucune protection chez les plus jeunes enfants ; un conjugué israélien avait obtenu 28 % au total ; et le précédent candidat vivant atténué, WRSs1, avait atteint 40 % dans un modèle d’épreuve thaïlandais. Un bioconjugué contre S. flexneri 2a, Flexyn2a, avait montré environ 30 % d’efficacité dans une étude d’épreuve américaine.
La réduction de dose fut une réponse de sécurité, non un choix de conception
L’essai avait débuté avec trois bras : deux doses de 10⁶ unités formant colonie (UFC), une dose unique de 10⁶ UFC, ou un placebo. Après l’administration à 69 participants, un comité indépendant de surveillance des données et de la sécurité (DSMB) a été convoqué, des participants développant des réactions gastro-intestinales de grade 3 au vaccin. Six des 108 participants inclus ont présenté des événements indésirables de grade 3 après vaccination au cours de l’essai, déclenchant deux revues de sécurité distinctes.
La première revue, en mars 2023, a fait suite à des nausées et diarrhées sévères chez deux participants — tous deux obèses et tous deux sous traitement amaigrissant. Le protocole a été amendé : la dose a été réduite de moitié à 5×10⁵ UFC, le recrutement dans le bras à dose unique a été arrêté, la randomisation est passée à 2:1, et toute personne avec un IMC supérieur à 40 ou sous médicaments amaigrissants a été exclue. Une seconde suspension, en janvier 2024, a suivi quatre autres événements de grade 3, dont deux liés à une infection intercurrente par le SARS-CoV-2 ou un norovirus. Aucune autre modification n’a été apportée. Aucun événement indésirable grave lié au vaccin ni aucun décès n’est survenu, et tous les participants concernés ont toléré leur seconde dose.
La conséquence pour le résultat d’efficacité est importante. La comparaison principale regroupe les deux niveaux de dose, mais la ventilation diffère nettement : les trois échecs sont tous survenus chez les 16 participants ayant reçu deux doses à 10⁶ UFC. Parmi les 18 ayant reçu la dose réduite de 5×10⁵ UFC, aucun. Parmi les 13 ayant reçu une dose unique de 10⁶ UFC, aucun non plus. Ces chiffres par groupe sont exploratoires, sous-dimensionnés et ne fondent aucune affirmation formelle. Ils expliquent en revanche pourquoi les auteurs recommandent la dose plus faible pour la suite du développement.
Ils font aussi, selon notre analyse, du chiffre groupé de 89 % un résumé plus fragile de l’essai qu’il n’y paraît. Ce chiffre moyenne une dose ayant produit trois échecs sur 16 participants et une autre n’en ayant produit aucun sur 18 — sur des effectifs bien trop faibles pour établir si cette différence est réelle ou fortuite. Soit les doses ont réellement différé, auquel cas les regrouper décrit un schéma que personne n’envisage d’utiliser ; soit elles n’ont pas différé, auquel cas l’amendement de sécurité qui les a séparées constitue l’événement le plus lourd de conséquences de l’essai. L’article rapporte tout cela clairement ; il n’en tire pas cette conclusion. Cette conclusion est la nôtre.
L’immunologie ajoute une nuance supplémentaire : les titres d’anticorps ont culminé environ deux semaines après la première dose et n’ont pas remonté après la seconde, ce que les auteurs interprètent comme l’absence de bénéfice net d’une seconde dose dans ce modèle.
Pourquoi Shigella est une cible difficile
La shigellose se transmet par contamination fécale des aliments, de l’eau et des surfaces, ainsi que par contact sexuel, provoquant diarrhée inflammatoire, fièvre et crampes abdominales. Son fardeau se concentre dans les pays à revenu faible et intermédiaire, où les enfants de un à cinq ans représentent la majorité des cas et des décès.
La répartition des espèces complique le déploiement. S. sonnei, ciblée par WRSs2, prédomine dans les pays à revenu élevé ; S. flexneri prédomine là où la mortalité est la plus forte. Les auteurs notent qu’un candidat multivalent couvrant S. sonnei ainsi que S. flexneri 2a, 3a et 6 serait nécessaire pour un usage mondial.
La résistance constitue l’argument le plus tranchant. Les Centers for Disease Control and Prevention américains estiment à environ 450 000 le nombre d’infections annuelles aux États-Unis, dont quelque 242 000 résistantes aux antimicrobiens. La tendance est plus frappante encore : une surveillance des CDC publiée en 2026 montre que les isolats ultrarésistants (XDR) — résistants à l’ampicilline, l’azithromycine, la ceftriaxone, la ciprofloxacine et au triméthoprime-sulfaméthoxazole — sont passés de zéro sur la période 2011–2015 à 8,5 % des isolats en 2023, sans qu’aucun antibiotique oral approuvé par la FDA ne permette de les traiter. La proportion XDR était environ deux fois plus élevée parmi les isolats de S. flexneri que dans la surveillance globale — soit précisément l’espèce qu’un vaccin contre S. sonnei ne couvre pas.
Efficacité n’est pas effectivité
Les auteurs de l’essai sont francs sur la portée de leur résultat. Les candidats vivants oraux contre Shigella ont un historique d’échecs hors des pays à revenu élevé : le vaccin vivant atténué SC602 avait montré une protection chez des adultes américains, mais une faible excrétion et une immunogénicité médiocre lors de son évaluation au Bangladesh. Les différences de microbiote intestinal, de nutrition, d’exposition antérieure, de co-infections et d’entéropathie environnementale y contribuent vraisemblablement. Le modèle d’infection contrôlée, écrivent les auteurs, ne peut rendre compte de cette hétérogénéité, et le vaccin n’a été testé ni chez l’enfant ni dans aucune population d’endémie.
Deux autres limites méritent d’être signalées. L’intervalle de 28 jours entre la vaccination et l’épreuve ne permet rien de conclure sur la durée de la protection. Par ailleurs, un receveur du placebo s’est révélé positif à la souche vaccinale deux semaines après sa seconde dose de placebo — les auteurs n’ont pu déterminer s’il s’agissait d’un artefact de laboratoire ou d’une véritable transmission interhumaine d’un organisme vaccinal vivant, et signalent ce point comme une mise en garde pour l’interprétation des données d’excrétion.
Face à ces réserves se tient un avantage pratique. Un vaccin oral n’exige ni injecteur formé, ni matériel stérile, et moins de chaîne du froid qu’un vaccin parentéral, ce qui le rend selon les auteurs plus déployable précisément dans les contextes à ressources limitées où le fardeau se concentre — s’il y fonctionne.
La suite
Les auteurs recommandent la dose de 5×10⁵ UFC pour la suite de l’évaluation et appellent à des essais dans les populations d’endémie, y compris chez les jeunes enfants, parallèlement à des travaux sur la durabilité, la protection croisée contre d’autres sérotypes et la co-administration avec les vaccins pédiatriques de routine. La dose et le calendrier devront vraisemblablement être optimisés chez l’enfant.
Ce que l’essai établit est une preuve de principe : l’immunité intestinale contre Shigella peut être induite par voie orale, et la protection peut être importante. Ce qu’il n’établit pas, c’est qu’il en ira de même chez un jeune enfant bangladais doté d’un microbiote différent, exposé de façon naturelle et répétée, et sans unité d’hospitalisation. Combler cet écart représente les prochaines années de travail.